Većina rijeka Hondurasa je planinska. Otvara se popis najvećih rijeka u cijeloj republici - Patuka, Ulua i Aguan.
Rijeka Aguan
Rijeka prolazi teritorijima sjevernog Hondurasa, počevši od odjela Yoro. Zatim odlazi na putovanje, birajući istočni smjer, prelazeći zemlje departmana Colon. A putovanje završava ulijevanjem u vode Karipskog mora (u blizini Santa Rosa de Aguán). Ukupna duljina struje doseže gotovo četiri stotine kilometara. Aguana ima nekoliko pritoka.
Dolina rijeke aktivno se koristi u poljoprivredi. U dolini u gornjem / srednjem dijelu potoka nalaze se polja s povrćem, te nasadi kukuruza i graha. Dolina donjeg toka prepuštena je riži i agrumima. Ovdje se uzgajaju i uljna palma i platan.
Rijeka Riu-Sumpul
Rio Sumpul probija se kroz zemlje dviju država odjednom - El Salvador (njegov sjeverozapadni dio) i Honduras (jugozapadna područja). Rijeka je vrlo kratka - samo sedamdeset sedam kilometara - i cijelom svojom dužinom služi kao granica koja dijeli teritorije ovih država.
Izvor Rio Simpul nalazi se u El Salvadoru. Tamo rijeka prelazi nekoliko općina (sve se nalaze u jednom odjelu - Chalatenango). Ulijeva se u vode Rio Lempa.
Rijeka Rio Torola
Rio Torola prolazi kroz Srednju Ameriku, teče kroz zemlje El Salvador (sjeveroistok) i Honduras (južni dio republike). Ukupno trajanje Rio Torole je nešto više od stotinu kilometara. Rijeka nastaje na teritoriju Salvadora na mjestu gdje se rijeka Lahitas spaja s potokom Mansukupagua. Ušće Rio Torole su vode Rio Lempa.
Rijeka Ulua
Korijeno rijeke probija teritorij Hondurasa u njegovu sjevernom dijelu, počevši od zemljišta odjela Intibuca (nedaleko od La Paza, padina planina Cordillera de Mentesillos). Ukupna duljina struje iznosi 358 kilometara s ukupnom slivnom površinom od gotovo dvadeset tri tisuće kvadrata.
Rijeka je nastala ušću rijeka Sasagua u Puringla. Uzvodno je poznat kao Rio Grande de Otoro. U početku, rijeka juri prema sjeveru, prelazeći Santa Barbaru u tranzitu, ali nakon toga Ulua naglo skreće na zapad i zaobilazeći tri odjela - Yoro, Cortes i Atlantidu - dovršava put u vodama Honduraškog zaljeva.
Rijeka Goaskoran
Goaskoran prolazi stazom kroz zemlje Honduras i El Salvador, prelazeći zemlje u južnom dijelu. Duljina struje je oko sto trideset kilometara sa slivom od dvije tisuće šest stotina šezdeset i tri četvorna kilometra.
Posljednjih osamnaest kilometara tekućine prirodna je granica između dviju država. Voda Goaskoran izvor je pitke vode za stanovnike zemlje koji žive na njenim obalama.
